Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ldb1P70662 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ldb1P70662 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms