Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erbb2P70424 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erbb2P70424 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erbb2P70424 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Erbb2P70424 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms