Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Tp53bp1P70399 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tp53bp1P70399 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53bp1P70399 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms