Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tbx6P70327 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tbx6P70327 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tbx6P70327 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tbx6P70327 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tbx6P70327 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tbx6P70327 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tbx6P70327 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tbx6P70327 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tbx6P70327 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tbx6P70327 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx6P70327 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms