Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb13P70321 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb13P70321 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb13P70321 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb13P70321 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxb13P70321 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb13P70321 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms