Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cux2P70298 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cux2P70298 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cux2P70298 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Cux2P70298 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cux2P70298 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cux2P70298 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cux2P70298 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cux2P70298 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cux2P70298 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cux2P70298 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cux2P70298 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cux2P70298 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux2P70298 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux2P70298 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cux2P70298 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cux2P70298 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux2P70298 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cux2P70298 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cux2P70298 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cux2P70298 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Cux2P70298 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cux2P70298 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cux2P70298 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms