Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vamp7P70280 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vamp7P70280 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp7P70280 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms