Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chl1P70232 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chl1P70232 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chl1P70232 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Chl1P70232 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chl1P70232 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chl1P70232 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chl1P70232 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chl1P70232 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chl1P70232 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chl1P70232 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chl1P70232 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chl1P70232 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms