Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkcbP68404 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkcbP68404 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcbP68404 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkcbP68404 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms