Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabrb3P63080 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabrb3P63080 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabrb3P63080 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms