Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl39P62892 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39P62892 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms