Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra1P62812 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra1P62812 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms