Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abce1P61222 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abce1P61222 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abce1P61222 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abce1P61222 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abce1P61222 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Abce1P61222 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abce1P61222 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abce1P61222 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Abce1P61222 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abce1P61222 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Abce1P61222 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abce1P61222 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abce1P61222 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abce1P61222 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abce1P61222 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abce1P61222 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abce1P61222 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Abce1P61222 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abce1P61222 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abce1P61222 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abce1P61222 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abce1P61222 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abce1P61222 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abce1P61222 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abce1P61222 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abce1P61222 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abce1P61222 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abce1P61222 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abce1P61222 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abce1P61222 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abce1P61222 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abce1P61222 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abce1P61222 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Abce1P61222 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abce1P61222 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abce1P61222 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms