Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem258P61166 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem258P61166 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem258P61166 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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