Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Fgf1P61148 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fgf1P61148 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf1P61148 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms