Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2mP61082 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2mP61082 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2mP61082 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2mP61082 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2mP61082 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2mP61082 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2mP61082 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2mP61082 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2mP61082 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2mP61082 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2mP61082 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2mP61082 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2mP61082 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2mP61082 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2mP61082 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2mP61082 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2mP61082 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms