Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2d1P61080 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d1P61080 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2d1P61080 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d1P61080 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d1P61080 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d1P61080 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2d1P61080 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2d1P61080 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ube2d1P61080 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms