Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfia3P60469 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia3P60469 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia3P60469 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms