Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3b6P59708 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b6P59708 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b6P59708 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms