Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup43P59235 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup43P59235 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup43P59235 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup43P59235 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup43P59235 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup43P59235 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms