Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scarf2P59222 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scarf2P59222 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scarf2P59222 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms