Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp1P59054 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Csrnp1P59054 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Csrnp1P59054 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Csrnp1P59054 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms