Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdrg1P59048 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdrg1P59048 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms