Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps33bP59016 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps33bP59016 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps33bP59016 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps33bP59016 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms