Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm2P58774 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm2P58774 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tpm2P58774 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm2P58774 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms