Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tlr8P58682 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlr8P58682 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tlr8P58682 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tlr8P58682 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms