Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Strn4P58404 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Strn4P58404 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Strn4P58404 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Strn4P58404 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Strn4P58404 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Strn4P58404 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Strn4P58404 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Strn4P58404 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Strn4P58404 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Strn4P58404 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Strn4P58404 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Strn4P58404 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms