Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn4P57780 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn4P57780 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn4P57780 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actn4P57780 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn4P57780 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actn4P57780 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn4P57780 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn4P57780 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn4P57780 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn4P57780 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn4P57780 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn4P57780 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Actn4P57780 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms