Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gsc2P56916 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gsc2P56916 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305.8 ms