Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp5P56399 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp5P56399 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp5P56399 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp5P56399 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp5P56399 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp5P56399 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp5P56399 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp5P56399 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp5P56399 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp5P56399 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp5P56399 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp5P56399 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms