Protein–RNA interactions for Protein: P54869

Hmgcs2, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcs2P54869 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgcs2P54869 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgcs2P54869 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgcs2P54869 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgcs2P54869 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms