Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NrlP54846 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrlP54846 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrlP54846 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrlP54846 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrlP54846 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrlP54846 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrlP54846 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrlP54846 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrlP54846 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrlP54846 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrlP54846 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrlP54846 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrlP54846 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrlP54846 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrlP54846 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrlP54846 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrlP54846 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrlP54846 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrlP54846 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrlP54846 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrlP54846 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrlP54846 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrlP54846 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrlP54846 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NrlP54846 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrlP54846 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrlP54846 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrlP54846 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrlP54846 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrlP54846 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrlP54846 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrlP54846 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrlP54846 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NrlP54846 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrlP54846 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrlP54846 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrlP54846 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NrlP54846 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NrlP54846 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NrlP54846 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrlP54846 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NrlP54846 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrlP54846 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrlP54846 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NrlP54846 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NrlP54846 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NrlP54846 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrlP54846 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrlP54846 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrlP54846 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrlP54846 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrlP54846 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NrlP54846 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrlP54846 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NrlP54846 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrlP54846 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NrlP54846 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NrlP54846 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NrlP54846 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NrlP54846 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NrlP54846 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NrlP54846 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NrlP54846 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NrlP54846 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NrlP54846 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NrlP54846 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NrlP54846 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NrlP54846 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NrlP54846 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NrlP54846 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NrlP54846 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NrlP54846 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NrlP54846 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NrlP54846 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NrlP54846 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NrlP54846 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NrlP54846 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NrlP54846 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NrlP54846 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NrlP54846 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NrlP54846 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NrlP54846 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NrlP54846 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NrlP54846 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NrlP54846 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NrlP54846 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NrlP54846 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NrlP54846 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms