Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb3P54754 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb3P54754 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb3P54754 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms