Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb3P54285 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacnb3P54285 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacnb3P54285 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacnb3P54285 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms