Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PklrP53657 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PklrP53657 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PklrP53657 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PklrP53657 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PklrP53657 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PklrP53657 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PklrP53657 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PklrP53657 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PklrP53657 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PklrP53657 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PklrP53657 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PklrP53657 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PklrP53657 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PklrP53657 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PklrP53657 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PklrP53657 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PklrP53657 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PklrP53657 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PklrP53657 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PklrP53657 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PklrP53657 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PklrP53657 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PklrP53657 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PklrP53657 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PklrP53657 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PklrP53657 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PklrP53657 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PklrP53657 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PklrP53657 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PklrP53657 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PklrP53657 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PklrP53657 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PklrP53657 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PklrP53657 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PklrP53657 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PklrP53657 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PklrP53657 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PklrP53657 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PklrP53657 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PklrP53657 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PklrP53657 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PklrP53657 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PklrP53657 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PklrP53657 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PklrP53657 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PklrP53657 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PklrP53657 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PklrP53657 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PklrP53657 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PklrP53657 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PklrP53657 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PklrP53657 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PklrP53657 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PklrP53657 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PklrP53657 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PklrP53657 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PklrP53657 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PklrP53657 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PklrP53657 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PklrP53657 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PklrP53657 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PklrP53657 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PklrP53657 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PklrP53657 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PklrP53657 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PklrP53657 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PklrP53657 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PklrP53657 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PklrP53657 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PklrP53657 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PklrP53657 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PklrP53657 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PklrP53657 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PklrP53657 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PklrP53657 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PklrP53657 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PklrP53657 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PklrP53657 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PklrP53657 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PklrP53657 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PklrP53657 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PklrP53657 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PklrP53657 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PklrP53657 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PklrP53657 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PklrP53657 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PklrP53657 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PklrP53657 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PklrP53657 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PklrP53657 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms