Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtbP53612 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtbP53612 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtbP53612 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms