Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XpcP51612 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XpcP51612 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XpcP51612 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XpcP51612 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XpcP51612 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XpcP51612 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XpcP51612 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XpcP51612 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XpcP51612 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XpcP51612 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
XpcP51612 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XpcP51612 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XpcP51612 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XpcP51612 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XpcP51612 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XpcP51612 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XpcP51612 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XpcP51612 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XpcP51612 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
XpcP51612 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XpcP51612 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
XpcP51612 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XpcP51612 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XpcP51612 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XpcP51612 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XpcP51612 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XpcP51612 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XpcP51612 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XpcP51612 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XpcP51612 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XpcP51612 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XpcP51612 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XpcP51612 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XpcP51612 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XpcP51612 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XpcP51612 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XpcP51612 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XpcP51612 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XpcP51612 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XpcP51612 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XpcP51612 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XpcP51612 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XpcP51612 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XpcP51612 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XpcP51612 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XpcP51612 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XpcP51612 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XpcP51612 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XpcP51612 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XpcP51612 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XpcP51612 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XpcP51612 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XpcP51612 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XpcP51612 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XpcP51612 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XpcP51612 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XpcP51612 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XpcP51612 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XpcP51612 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XpcP51612 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XpcP51612 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XpcP51612 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XpcP51612 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XpcP51612 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XpcP51612 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XpcP51612 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XpcP51612 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XpcP51612 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XpcP51612 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XpcP51612 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XpcP51612 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XpcP51612 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XpcP51612 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XpcP51612 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XpcP51612 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XpcP51612 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XpcP51612 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XpcP51612 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XpcP51612 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XpcP51612 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XpcP51612 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XpcP51612 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XpcP51612 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XpcP51612 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XpcP51612 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XpcP51612 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
XpcP51612 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XpcP51612 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XpcP51612 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms