Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa9P50707 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa9P50707 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa9P50707 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa9P50707 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa9P50707 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa9P50707 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa9P50707 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa9P50707 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa9P50707 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms