Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SftpbP50405 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SftpbP50405 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpbP50405 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpbP50405 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SftpbP50405 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpbP50405 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpbP50405 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SftpbP50405 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SftpbP50405 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SftpbP50405 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SftpbP50405 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SftpbP50405 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SftpbP50405 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SftpbP50405 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SftpbP50405 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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