Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LtbrP50284 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LtbrP50284 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LtbrP50284 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LtbrP50284 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LtbrP50284 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LtbrP50284 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LtbrP50284 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LtbrP50284 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LtbrP50284 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LtbrP50284 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms