Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxc13P50207 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc13P50207 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc13P50207 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms