Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atoh1P48985 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh1P48985 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atoh1P48985 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atoh1P48985 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atoh1P48985 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms