Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx3P48759 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ptx3P48759 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx3P48759 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx3P48759 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms