Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PcntP48725 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PcntP48725 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PcntP48725 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PcntP48725 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PcntP48725 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PcntP48725 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PcntP48725 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcntP48725 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcntP48725 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcntP48725 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcntP48725 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcntP48725 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcntP48725 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcntP48725 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcntP48725 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcntP48725 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcntP48725 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcntP48725 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcntP48725 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcntP48725 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcntP48725 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PcntP48725 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcntP48725 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcntP48725 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcntP48725 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcntP48725 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcntP48725 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcntP48725 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcntP48725 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcntP48725 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcntP48725 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcntP48725 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PcntP48725 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcntP48725 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PcntP48725 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcntP48725 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcntP48725 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcntP48725 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcntP48725 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcntP48725 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcntP48725 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcntP48725 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcntP48725 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcntP48725 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcntP48725 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcntP48725 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcntP48725 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcntP48725 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcntP48725 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcntP48725 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcntP48725 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcntP48725 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcntP48725 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcntP48725 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PcntP48725 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PcntP48725 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcntP48725 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcntP48725 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcntP48725 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcntP48725 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PcntP48725 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PcntP48725 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PcntP48725 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PcntP48725 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PcntP48725 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PcntP48725 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PcntP48725 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PcntP48725 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PcntP48725 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PcntP48725 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PcntP48725 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcntP48725 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PcntP48725 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PcntP48725 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PcntP48725 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PcntP48725 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PcntP48725 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PcntP48725 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PcntP48725 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PcntP48725 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PcntP48725 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PcntP48725 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PcntP48725 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PcntP48725 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PcntP48725 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PcntP48725 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PcntP48725 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PcntP48725 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PcntP48725 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms