Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcd1P48410 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcd1P48410 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Abcd1P48410 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcd1P48410 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms