Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gbx2P48031 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbx2P48031 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbx2P48031 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms