Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Igfbp6P47880 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Igfbp6P47880 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Igfbp6P47880 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Igfbp6P47880 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms