Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrprbP47758 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrprbP47758 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrprbP47758 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SrprbP47758 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SrprbP47758 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SrprbP47758 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SrprbP47758 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrprbP47758 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SrprbP47758 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SrprbP47758 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrprbP47758 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrprbP47758 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SrprbP47758 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrprbP47758 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms