Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc2P46471 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psmc2P46471 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms