Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf6P43028 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf6P43028 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf6P43028 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms